Klinisk biokemisk afdeling - Metodeliste
Rigshospitalets Labportal
Rigshospitalets Labportal
Email: rh-labportal@regionh.dk
 
  Forside    Laboratorieundersøgelser    Laboratorier    Generel Information    Om LabPortalen  
DNANGCCAFA
DNA(Lkc;B)—
Genomsekventering NGC  
Labka/SP:
DNA—
NationaltGenomCenter,NGC WGS - Kræft hos unge voksne (18-30 år) samt arvelig kræft hos voksne (version 1)  
Bestillingskode i SP:
EPC00349
 Datablad
Rekvirering:
Laboratorium: Rigshospitalet Blegdamsvej, Afdeling for Genomisk Medicin
Analysegruppe/Ansvarlig:Genomisk Medicin 4113
Seneste gennemgang - Initialer : 14/11/2024 - JBF
IFCC-IUPAC-kode og navn:EPC00349
Synonymer:WGS, whole genome sequencing, helgenomsekventering, helgenom, NGC, Nationalt Genom Center
Beskrivelse:

Genomsekventering af prøver for Nationalt Genom Center (NGC)

Akkrediteret analyse:DANAK
Metodeopsætning:
CE-mærket analyseopsætning:
Mutationdetektionsprincip:
Metrologisk sporbarhed:
Prøvemateriale:EDTA-stabiliseret blod + frisk biopsi i RNA-later
Alternativt prøvemateriale:
Prøvetagningsrør (Labka):

Standard: lilla3S: 2 x 3 mL EDTA (1 screeningsglas + 1 kontrolglas)
Microrør: 1 x 500 uL kapillært (1 screeningsglas)


Frisk væv: 2 biopsier i hvert sit rør. 6 ml RNA-later. Biopsi skal være dækket.


Alternativt friskfrosset væv på tøris.

Prøvemængde:Ved blodprøvetagning af børn, vurderes altid om der kan udtages blod ved standard procedure eller om microrør skal anvendes.

Standard: 2 x 3 mL EDTA (1 screeningsglas + 1 kontrolglas)
Microrør: 1 x 500 uL kapillært (1 screeningsglas)

Hvis udtagning af blod ikke er mulig, kan kindskrab anvendes.
For vejledning kontaktes Genomisk Medicin tlf. 3545 4113
Opbevaring, holdbarhed og forsendelse:Opbevaring: Køl eller stuetemp.
Forsendelse: Stuetemp.
Prøverør sendes med almindelig post eller fragtmand inklusiv sendeseddel med oplysninger om prøveID, afsender, modtager og forsendelsesdato.
Må sendes med rørpost:Ja
Svarafgivelse:Formsvar eller data
Svartid:Sekventeringsdata fra helgenomsekventering er tilgængelig for fortolkende afdeling indenfor 7-17 dage efter prøvemodtagelsen. For svartid på klinisk svar kontakt venligst fortolkende afdeling. Ved tvivl herom kontakt venligst vagthavende læge/AC på Afdeling for Genomisk Medicin, RH (35453110)

Ekstern kvalitetskontrol:
Svartid:
Svarmuligheder:
Analyseusikkerhed:  
Kommentar (ved rekvirering):Ved forsendelse af blodprøve: Analysen kan rekvireres i SP (EPC00349) eller ved NGC rekvisitionsseddel (www.NGC.dk se under Blanketter og vejledninger)

Ved forsendelse af oprenset DNA eller vævsprøve: Analysen rekvireres ved udfyldelse af NGC rekvisitionsseddel (www.NGC.dk se under Blanketter og vejledninger) som medsendes prøven til Afdeling for Genomisk Medicin, RH.

Forud for bestilling af analysen, skal skriftligt samtykke være indhentet. Blanket for informeret samtykke kan downloades fra www.NGC.dk (se under Blanketter og vejledninger) og skal scannes i SP under fanen: MEDIA.

Kontrolprøve til intern kvalitetskontrol medbestilles automatisk.

Se endvidere vejledning for bestilling af helgenomsekventering i regi af NGC: https://vip.regionh.dk/VIP/Admin/GUI.nsf/Desktop.html

Gyldig fra:06/01/2023
Gyldig til:
 Sortimentslister  
Indgår på liste Kode Hospital
RH-BLV Rigshospitalet Blegdamsvej
RH-GLO Rigshospitalet Glostrup