Klinisk biokemisk afdeling - Metodeliste
Rigshospitalets Labportal
Rigshospitalets Labportal
Email: rh-labportal@regionh.dk
 
  Forside    Laboratorieundersøgelser    Laboratorier    Generel Information    Om LabPortalen  
DNANGCCAHÆ
DNA(Lkc;B)—
Genomsekventering NGC  
Labka/SP:
DNA—
NationaltGenomCenter,NGC WGS - Hæmatologisk kræft (version 1)  
Bestillingskode i SP:
EPC00347
 Datablad
Rekvirering:
Laboratorium: Rigshospitalet Blegdamsvej, Afdeling for Genomisk Medicin
Analysegruppe/Ansvarlig:Genomisk Medicin 4113
Seneste gennemgang - Initialer : 24/02/2023 - JBF
IFCC-IUPAC-kode og navn:EPC00347
Synonymer:WGS, whole genome sequencing, helgenomsekventering, helgenom, NGC, Nationalt Genom Center
Beskrivelse:

Genomsekventering af prøver for Nationalt Genom Center (NGC)

Akkrediteret analyse:DANAK
Metodeopsætning:
CE-mærket analyseopsætning:
Mutationdetektionsprincip:
Metrologisk sporbarhed:
Prøvemateriale:EDTA-stabiliseret blod, oprenset DNA og knoglemarv
Alternativt prøvemateriale:
Prøvetagningsrør (Labka):

Standard: lilla3S: 2 x 3 mL EDTA (1 screeningsglas + 1 kontrolglas)
Microrør: 1 x 500 uL kapillært (1 screeningsglas)
Marv: lilla3S: 1 x minimum 1 ml marv i EDTA.

Prøvemængde:Blodprøve: Ved blodprøvetagning af børn, vurderes altid om der kan udtages blod ved standard procedure eller om microrør skal anvendes.

Standard: 2 x 3 mL EDTA (1 screeningsglas + 1 kontrolglas)
Microrør: 1 x 500 uL kapillært (1 screeningsglas)

Bemærk, at germline prøven skal være enten kindskrab eller DNA fra dyrkede fribroblaster. Fremsendes efter aftale.
For vejledning kontaktes Genomisk Medicin tlf. 3545 4113.

Marv: Minimum 1 ml marv i EDTA blodprøveglas. Vigtigt! Opbevares på knust is i en kop straks efter prøvetagningen. Marv transporteres straks på is til Genomisk Medicin 4113 eller afhentes af bioanalytiker efter aftale. For afhentning kontakt 3545 4116.
Hvis afdeling ej har knust is, skal marven placeres i køleblok og 4113 varsles, at de skal medbringe is ved afhentning.
Opbevaring, holdbarhed og forsendelse:Opbevaring: Køl eller stuetemp.
Forsendelse: Stuetemp.
Prøverør sendes med almindelig post eller fragtmand inklusiv sendeseddel med oplysninger om prøveID, afsender, modtager og forsendelsesdato.
Må sendes med rørpost:Ja
Svarafgivelse:Formsvar eller data
Svartid:Sekventeringsdata fra helgenomsekventering er tilgængelig for fortolkende afdeling indenfor 7-17 dage efter prøvemodtagelsen. For svartid på klinisk svar kontakt venligst fortolkende afdeling. Ved tvivl herom kontakt venligt vagthavende læge/AC på Afdeling for Genomisk Medicin, RH (35453110)
Ekstern kvalitetskontrol:
Svartid:
Svarmuligheder:
Analyseusikkerhed:  
Kommentar (ved rekvirering):Ved forsendelse af blodprøve: Analysen kan rekvireres i SP (EPC00347) eller ved NGC rekvisitionsseddel (www.NGC.dk se under Blanketter og vejledninger)

Ved forsendelse af oprenset DNA eller vævsprøve: Analysen rekvireres ved udfyldelse af NGC rekvisitionsseddel (www.NGC.dk se under Blanketter og vejledninger) som medsendes prøven til Afdeling for Genomisk Medicin, RH.

Forud for bestilling af analysen, skal skriftligt samtykke være indhentet. Blanket for informeret samtykke kan downloades fra www.NGC.dk (se under Blanketter og vejledninger) og skal scannes i SP under fanen: MEDIA.

Kontrolprøve til intern kvalitetskontrol medbestilles automatisk.

Se endvidere vejledning for bestilling af helgenomsekventering i regi af NGC: https://vip.regionh.dk/VIP/Admin/GUI.nsf/Desktop.html
Gyldig fra:06/01/2023
Gyldig til:
 Sortimentslister  
Indgår på liste Kode Hospital
RH-BLV Rigshospitalet Blegdamsvej
RH-GLO Rigshospitalet Glostrup