| |
| Rekvirering | |
| Kode (SP) | EPC00347 |
| Analyse/undersøgelsesnavn - SP | NationaltGenomCenter,NGC WGS - Hæmatologisk kræft;DNA |
| IFCC-IUPAC-kode og navn | EPC00347 |
| Synonymer | WGS, whole genome sequencing, helgenomsekventering, helgenom, NGC, Nationalt Genom Center
|
| Beskrivelse af analyse | Genomsekventering af prøver for Nationalt Genom Center (NGC) |
| Oplysninger ved rekvirering | Ved forsendelse af blodprøve: Analysen kan rekvireres i SP (EPC00347) eller ved NGC rekvisitionsseddel (www.NGC.dk se under Blanketter og vejledninger)
Ved forsendelse af oprenset DNA eller vævsprøve: Analysen rekvireres ved udfyldelse af NGC rekvisitionsseddel (www.NGC.dk se under Blanketter og vejledninger) som medsendes prøven til Afdeling for Genomisk Medicin, RH.
Forud for bestilling af analysen, skal skriftligt samtykke være indhentet. Blanket for informeret samtykke kan downloades fra www.NGC.dk (se under Blanketter og vejledninger) og skal scannes i SP under fanen: MEDIA.
Kontrolprøve til intern kvalitetskontrol medbestilles automatisk.
Se endvidere vejledning for bestilling af helgenomsekventering i regi af NGC: https://vip.regionh.dk/VIP/Admin/GUI.nsf/Desktop.html
|
| Prøvemateriale | EDTA-stabiliseret blod, oprenset DNA og knoglemarv |
| Volumen/mængde | Blodprøve: Ved blodprøvetagning af børn, vurderes altid om der kan udtages blod ved standard procedure eller om microrør skal anvendes.
Standard: 2 x 3 mL EDTA (1 screeningsglas + 1 kontrolglas)
Microrør: 1 x 500 uL kapillært (1 screeningsglas)
Bemærk, at germline prøven skal være enten kindskrab eller DNA fra dyrkede fribroblaster. Fremsendes efter aftale.
For vejledning kontaktes Genomisk Medicin tlf. 3545 4113.
Marv: Minimum 1 ml marv i EDTA blodprøveglas. Vigtigt! Opbevares på knust is i en kop straks efter prøvetagningen. Marv transporteres straks på is til Genomisk Medicin 4113 eller afhentes af bioanalytiker efter aftale. For afhentning kontakt 3545 4116.
Hvis afdeling ej har knust is, skal marven placeres i køleblok og 4113 varsles, at de skal medbringe is ved afhentning. |
| Prøvebeholder inkl. additiver | Standard: lilla3S: 2 x 3 mL EDTA (1 screeningsglas + 1 kontrolglas)
Microrør: 1 x 500 uL kapillært (1 screeningsglas)
Marv: lilla3S: 1 x minimum 1 ml marv i EDTA. |
| Mærkning af (primær) prøvebeholder | Prøverør skal være mærket med ID identisk med ID anvendt på rekvisitionsseddel og samtykkeerklæring. Ønskeligt angives altid CPR-nummer på prøverør evt. inklusiv anden prøveID, f.eks. en stregkode. Anvendelse af stregkoder bør være GS1 compliant (f.eks. LABKA-prøvenumre) og placeres på en sådan måde, at scanning tillades.
|
| Opbevaring, holdbarhed og forsendelse | Opbevaring: Køl eller stuetemp.
Forsendelse: Stuetemp.
Prøverør sendes med almindelig post eller fragtmand inklusiv sendeseddel med oplysninger om prøveID, afsender, modtager og forsendelsesdato. |
| Må sendes med rørpost | Ja |
| Svartid fra modtagelse på udførende laboratorium | Sekventeringsdata fra helgenomsekventering er tilgængelig for fortolkende afdeling indenfor 7-17 dage efter prøvemodtagelsen. For svartid på klinisk svar kontakt venligst fortolkende afdeling. Ved tvivl herom kontakt venligt vagthavende læge/AC på Afdeling for Genomisk Medicin, RH (35453110) |
| Svarafgivelse | Formsvar eller data |
| Afleveringssted og afleveringstidspunkt | Afdeling for Genomisk Medicin
Afsnit 4113
Rigshospitalet
Blegdamsvej 9, 2100 Kbh. Ø
Prøver afleveres i prøvemodtagelsen
Hverdage mellem 8-15.30 |
| Nødprocedure | Rekvisitionsseddel benyttes ved nedbrud af prøvetagningsystemet |
| Gyldig fra | 06/01/2023 |
| Akkrediteret | DANAK
|
| Analysegruppe/Ansvarlig | Genomisk Medicin 4113 |
| Indtastet/Revideret | 24/02/2023 Initialer : JBF |
|
|
|
|
Tilbage